FileZilla เป็นเครื่องมือมาตรฐานของผู้พัฒนาเว็บไซต์มาหลายปีแล้วโดยปริยาย สำหรับมือใหม่ที่กำลังเริ่มติดตั้ง WordPress อาจเจอปัญหาเล็กๆน้อยๆ แต่ถ้าไม่สังเกตให้ดีอาจจะทำให้การอัพโหลดไม่สมบูรณ์ นั่นก็คือโปรแกรม WordPress หรือธีมหรือปลั๊กอินอื่นๆไม่ทำงาน
ปัญหาพื้นๆก็คือ
1. เมื่ออัพโหลดไฟล์จำนวนมาก (หลักพัน) สักพักโปรแกรมจะขึ้นหน้าจอว่า

มักเกิดจากเน็ตหรือ server สะดุดอะไรสักอย่าง ทำให้ FileZilla ไม่แน่ใจว่าไฟล์ที่กำลังจะอัพโหลดนั้นเป็นไฟล์เดิมที่อัพโหลดไปแล้ว แต่ไม่แน่ใจว่าสมบูรณ์หรือไม่ จึงได้ถามให้เรายืนยัน
อย่างนี้ให้คลิกที่ Always use this action (Overwrite ข้างบนไม่ต้องไปเปลี่ยน)
2. ถ้าต้องการหยุดการอัพโหลดชั่วขณะ
อันนี้ไม่ใช่ปัญหาแต่เป็นเรื่องที่บางคนอาจไม่รู้ เพราะว่าเวลาอัพโหลดก็รอจนกระทั่งมันอัพโหลดเสร็จ บางครั้งเราต้องการหยุดการอัพโหลดไว้ชั่วขณะหรือมีปัญหาเกิดขึ้น (ดูข้อ 3) ให้คลิกขวาที่แถบด้านบนภายใต้แท็บ Queued files
แล้วคลิก Process Queues การอัพโหลดจะหยุดพักไว้ แต่คิวการอัพโหลดยังอยู่ ถ้าต้องการทำต่อก็กลับมาคลิกที่ Process Queues อีกครั้ง

3. อัพโหลดแล้วมีตัวเลขขึ้นที่ Failed transfers
นี่แสดงว่ากระบวนการอัพโหลดมีปัญหา
3.1 ถ้าเริ่มมีตัวเลขขึ้นที่แท็บ Failed transfers แสดงว่ามีไฟล์ที่เริ่มอัพโหลดไม่ได้ และจะเพิ่มขั้นเรื่อยๆ อย่างนี้ให้หยุดการอัพโหลดตามวิธีที่ (2)
3.2 แล้วให้คลิกแท็บ Failed transfers คลิกขวาที่แถบข้างบนตามรูป แล้วเลือก Reset and requeue all
3.3 จำนวนไฟล์ที่อัพโหลดไม่ได้จะกลับไปรวมในแท็บ Queue files แล้วภายใต้แท็บนี้ ให้คลิก Process Queue ต่อ
ถ้าตัวเลขใน Failed transfers ยังขึ้นอีก ก็กลับไปทำ 3.(1.2.3) จนกว่าจะครบหมดทุกไฟล์ ถ้ายังขึ้นอีก ให้รอสักพักแล้วค่อยอัพใหม่ เพราะ server อาจ busy หรือถูกเซตไว้ให้ทิ้งช่วงการอัพโหลดติดๆกัน

ระวัง !!! ถ้าไฟล์ที่จะอัพมีเยอะ แล้วเกิดปัญหาอย่างนี้ ควรรอและทำให้เสร็จ เพราะถ้าปิด FileZilla ตอนนี้ คิวอาจจะหายไป ต้องกลับมาเริ่มใหม่หมด